基于FIPA与生物元数据的生物信息多Agent系统模型

来源期刊:中南大学学报(自然科学版)2005年第5期

论文作者:何红波 陈蓉 李宾 李义兵

文章页码:863 - 867

关键词:智能体;分布式生物信息;生物元数据; JADE

Key words:Agent; distributed bioinformatics; bio-metadata; JADE

摘    要:采用智能物理代理基金会(FIPA)提供的代理规范及元数据的智能体(Agent)技术,构建生物信息的集成系统,分析分布式生物信息中Agent的分类与结构;利用Java智能体开发环境JADE设计了一个面向分布式生物信息的多Agent原型系统Bio-Agents,并给出了其体系结构;开发了一种脚本语言Bioscript,研究了基于Agent的生物信息导航。应用结果表明:可以通过操纵生物信息功能Agent及控制Agent之间的关系来描述用户任务,用户在分析与查询复杂的生物信息数据库时,只需了解生物元数据库中的生物信息,按Bioscript语言来描述其所需要查询与分析的数据,就完全可以掌握数据库中的数据情况。

Abstract: The Agent technology based on the criterion provided by Foundation for Intelligent Physical Agent (FIPA) and the metadata was applied to constructing integrated framework of bio-informatics. Firstly, the classification and structure of Agent in distributed bio-informatics were analyzed, and the model of communication and distribution and the structure of system were built. Then the proto system Bio-Agents for the distributed bio-informatics multi-Agent system was designed by using Java Agent Development Environment(JADE); a script language Bioscript was also developed. The results shows that the tasks of user can be described by the operation of bio-informatics function agentand control of the relationship of Agent. If the user wants to analyze and query the complex bio-informatics database, the only thing needed is to know bio-information in the bio-metadata. The data can be analyzed and queried by Bioscript language.

基金信息:国家自然科学基金资助项目

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