油页岩微生物总DNA的提取方法
来源期刊:东北大学学报(自然科学版)2014年第4期
论文作者:蒋绍妍 王文星 薛向欣 侯晓娇
文章页码:588 - 592
关键词:油页岩;微生物总DNA;提取方法;PCR-DGGE;SDS高盐提取法;
摘 要:为建立油页岩微生物总DNA提取方法,以两矿区的6个样品为材料,采用SDS高盐、SDS液氮研磨、SDS反复冻融、SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法分别对总DNA进行提取.结果表明,各方法提取效果差异很大,改进的SDS高盐提取法效果最好,各样品均得到约23 kb较完整片段,且产率显著高于其他方法,达91.44386.85 ng·g-1干样;以未纯化的DNA为模板,对16S rDNA进行PCR-DGGE,得到了相应的扩增产物及DGGE指纹图谱,说明该法适合油页岩样品.SDS液氮研磨和SDS反复冻融提取法仅能得到部分样品总DNA,且产率和纯度较低,而SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法无DNA提出,不适合此类样品.
蒋绍妍1,王文星1,2,薛向欣1,侯晓娇2
1. 东北大学材料与冶金学院2. 东北大学生命科学与健康学院
摘 要:为建立油页岩微生物总DNA提取方法,以两矿区的6个样品为材料,采用SDS高盐、SDS液氮研磨、SDS反复冻融、SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法分别对总DNA进行提取.结果表明,各方法提取效果差异很大,改进的SDS高盐提取法效果最好,各样品均得到约23 kb较完整片段,且产率显著高于其他方法,达91.44386.85 ng·g-1干样;以未纯化的DNA为模板,对16S rDNA进行PCR-DGGE,得到了相应的扩增产物及DGGE指纹图谱,说明该法适合油页岩样品.SDS液氮研磨和SDS反复冻融提取法仅能得到部分样品总DNA,且产率和纯度较低,而SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法无DNA提出,不适合此类样品.
关键词:油页岩;微生物总DNA;提取方法;PCR-DGGE;SDS高盐提取法;