一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法

来源期刊：东北大学学报(自然科学版)2009年第1期

论文作者：于长永 王国仁 毛克明 翟文丹

文章页码：50 - 53

关键词：蛋白质鉴定;串联质谱;数据库搜索;信息论;匹配算法;

摘    要：为了有效地利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出了一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法——ITPIA(information theory based protein identification algorithm)算法.针对多肽串联质谱质量低、噪音多等问题,ITPIA算法利用了信息论中的熵理论提出了一种有效的实验串联质谱和多肽的理论质谱的匹配打分算法.该算法更大程度上从多肽串联质谱中获得蛋白质的结构信息.实验结果表明,ITPIA算法有效地提高了蛋白质鉴定的准确性.