肠炎沙门氏菌血清型特异性基因挖掘及生物信息学分析

来源期刊：江西理工大学学报2014年第3期

论文作者：余水静 彭艳平 邓扬悟 郭燕华 梁长利 欧阳城添

文章页码：13 - 17

关键词：肠炎沙门氏菌;血清型;特异性基因;生物信息学分析;

摘    要：肠炎沙门氏菌(Salmonella enterica serovar Enteritidis)能引起畜禽的胃肠炎以及食物中毒,其血清型鉴定较为复杂.为了挖掘肠炎沙门氏菌血清型特异性基因,以44个已测序沙门氏菌基因组构建数据库,利用肠炎沙门氏菌所有蛋白编码序列为查询序列,通过BLASTN比对,挖掘出6个肠炎沙门氏菌血清型特异性基因(SEN1382,SEN1383,SEN1388,SEN1936,SEN1945和SEN1959),其中4个基因编码噬菌体相关蛋白.同时,研究分析了肠炎沙门氏菌血清型特异性基因的理化性质、二级结构、三级结构、亚细胞定位、信号肽和跨膜区等特征,结果表明肠炎沙门氏菌血清型特异性基因具有多样性特征.挖掘的血清型特异性基因可为鉴定肠炎沙门氏菌提供检测靶标.