基于主判别变量法的近红外光谱STR基因分型专家系统

来源期刊：理化检验-化学分册2012年第5期

论文作者：张斌 鲁辉 汪雪娇 胡海燕 刘玲 谢洪平 顾炳仁

文章页码：516 - 1043

关键词：短串联重复序列;近红外光谱;主判别变量;基因分型专家系统;

摘    要：基于近红外光谱结合主判别变量算法对短串联重复序列（STR）基因分型专家系统进行研究。选择STR基因座D16S539中6种总核心重复串数不同且出现频率较高的基因型9-9、9-11、9-12、10-10、10-11和11-11作为研究对象。6种基因型样本分别通过两次聚合酶链反应（PCR）平行扩增,以扩增产物的近红外光谱作为判别变量建立判别模型。最后,基于该基因座6种基因型的总核心重复序列数的差异来构建其基因分型专家系统。结果表明:方法适用于不同差异程度的基因型分型,预测准确率高且稳健性好,这为建立其他基因座的分型专家系统提供了可行性。